Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolP10400 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolP10400 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolP10400 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolP10400 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP10400 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP10400 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP10400 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP10400 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP10400 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP10400 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP10400 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP10400 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP10400 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP10400 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP10400 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP10400 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP10400 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP10400 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP10400 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP10400 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP10400 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP10400 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolP10400 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolP10400 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolP10400 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PolP10400 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolP10400 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolP10400 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PolP10400 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolP10400 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PolP10400 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolP10400 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolP10400 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PolP10400 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolP10400 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolP10400 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolP10400 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolP10400 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolP10400 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PolP10400 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PolP10400 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP10400 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP10400 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP10400 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP10400 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP10400 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP10400 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP10400 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP10400 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP10400 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP10400 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP10400 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP10400 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP10400 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP10400 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP10400 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP10400 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP10400 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolP10400 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolP10400 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolP10400 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolP10400 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolP10400 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolP10400 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolP10400 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolP10400 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolP10400 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolP10400 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolP10400 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolP10400 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolP10400 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolP10400 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolP10400 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolP10400 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolP10400 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PolP10400 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PolP10400 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PolP10400 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PolP10400 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PolP10400 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PolP10400 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PolP10400 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PolP10400 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PolP10400 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PolP10400 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PolP10400 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PolP10400 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PolP10400 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PolP10400 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PolP10400 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PolP10400 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PolP10400 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PolP10400 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PolP10400 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PolP10400 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PolP10400 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PolP10400 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PolP10400 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PolP10400 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms