Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnmt3cP0DOY1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnmt3cP0DOY1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnmt3cP0DOY1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt3cP0DOY1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt3cP0DOY1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt3cP0DOY1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnmt3cP0DOY1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnmt3cP0DOY1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnmt3cP0DOY1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt3cP0DOY1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt3cP0DOY1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt3cP0DOY1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt3cP0DOY1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnmt3cP0DOY1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt3cP0DOY1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt3cP0DOY1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dnmt3cP0DOY1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnmt3cP0DOY1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt3cP0DOY1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt3cP0DOY1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt3cP0DOY1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnmt3cP0DOY1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnmt3cP0DOY1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnmt3cP0DOY1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnmt3cP0DOY1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnmt3cP0DOY1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnmt3cP0DOY1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dnmt3cP0DOY1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnmt3cP0DOY1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnmt3cP0DOY1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnmt3cP0DOY1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnmt3cP0DOY1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnmt3cP0DOY1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnmt3cP0DOY1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnmt3cP0DOY1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnmt3cP0DOY1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnmt3cP0DOY1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnmt3cP0DOY1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnmt3cP0DOY1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms