Protein–RNA interactions for Protein: P05214

Tuba3a, Tubulin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba3aP05214 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tuba3aP05214 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tuba3aP05214 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tuba3aP05214 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tuba3aP05214 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tuba3aP05214 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tuba3aP05214 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba3aP05214 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba3aP05214 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba3aP05214 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tuba3aP05214 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tuba3aP05214 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tuba3aP05214 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tuba3aP05214 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tuba3aP05214 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tuba3aP05214 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tuba3aP05214 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tuba3aP05214 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tuba3aP05214 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba3aP05214 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms