Protein–RNA interactions for Protein: P01821

Ig heavy chain V region MC101, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01821 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01821 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01821 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01821 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01821 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01821 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01821 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01821 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01821 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01821 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01821 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01821 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01821 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01821 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01821 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01821 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01821 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01821 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01821 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01821 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01821 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01821 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01821 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01821 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01821 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01821 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01821 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01821 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01821 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01821 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01821 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01821 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01821 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01821 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01821 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01821 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01821 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01821 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01821 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01821 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01821 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01821 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01821 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01821 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01821 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01821 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01821 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01821 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01821 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01821 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01821 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01821 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01821 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01821 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01821 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01821 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01821 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01821 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01821 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01821 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01821 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01821 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01821 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01821 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01821 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01821 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01821 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01821 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01821 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01821 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01821 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01821 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01821 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01821 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01821 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01821 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01821 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01821 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01821 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01821 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01821 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01821 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01821 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01821 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01821 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01821 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01821 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01821 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01821 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01821 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01821 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01821 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01821 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01821 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01821 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01821 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01821 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01821 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01821 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01821 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms