Protein–RNA interactions for Protein: O88907

Pias1, E3 SUMO-protein ligase PIAS1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias1O88907 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pias1O88907 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pias1O88907 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pias1O88907 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pias1O88907 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pias1O88907 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pias1O88907 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pias1O88907 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pias1O88907 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pias1O88907 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pias1O88907 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pias1O88907 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pias1O88907 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pias1O88907 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pias1O88907 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pias1O88907 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pias1O88907 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pias1O88907 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pias1O88907 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pias1O88907 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pias1O88907 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pias1O88907 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pias1O88907 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pias1O88907 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pias1O88907 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pias1O88907 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pias1O88907 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pias1O88907 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pias1O88907 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pias1O88907 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pias1O88907 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pias1O88907 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pias1O88907 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pias1O88907 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pias1O88907 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pias1O88907 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pias1O88907 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pias1O88907 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pias1O88907 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pias1O88907 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pias1O88907 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pias1O88907 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pias1O88907 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pias1O88907 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pias1O88907 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pias1O88907 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pias1O88907 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pias1O88907 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pias1O88907 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pias1O88907 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pias1O88907 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pias1O88907 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms