Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Kcnk4O88454 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Kcnk4O88454 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Kcnk4O88454 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24,04■■□□□ 1,44
Kcnk4O88454 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Kcnk4O88454 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Kcnk4O88454 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Kcnk4O88454 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Kcnk4O88454 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Kcnk4O88454 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Kcnk4O88454 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Kcnk4O88454 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Kcnk4O88454 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Kcnk4O88454 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Kcnk4O88454 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Kcnk4O88454 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Kcnk4O88454 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Kcnk4O88454 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Kcnk4O88454 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Kcnk4O88454 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23,97■■□□□ 1,43
Kcnk4O88454 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23,97■■□□□ 1,43
Kcnk4O88454 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Kcnk4O88454 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,43
Kcnk4O88454 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23,92■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Kcnk4O88454 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Kcnk4O88454 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Kcnk4O88454 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Kcnk4O88454 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Kcnk4O88454 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Kcnk4O88454 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Kcnk4O88454 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Kcnk4O88454 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Kcnk4O88454 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Kcnk4O88454 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Kcnk4O88454 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Kcnk4O88454 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23,83■■□□□ 1,4
Kcnk4O88454 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Kcnk4O88454 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Kcnk4O88454 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Kcnk4O88454 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Kcnk4O88454 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Kcnk4O88454 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,8■■□□□ 1,4
Kcnk4O88454 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Kcnk4O88454 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Kcnk4O88454 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Kcnk4O88454 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Kcnk4O88454 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Kcnk4O88454 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23,75■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23,75■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Kcnk4O88454 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23,68■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Kcnk4O88454 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Kcnk4O88454 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Kcnk4O88454 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23,63■■□□□ 1,37
Kcnk4O88454 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Kcnk4O88454 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Kcnk4O88454 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,9 ms