Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vti1bO88384 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vti1bO88384 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vti1bO88384 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vti1bO88384 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vti1bO88384 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms