Protein–RNA interactions for Protein: O70570

Pigr, Polymeric immunoglobulin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigrO70570 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PigrO70570 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PigrO70570 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PigrO70570 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PigrO70570 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PigrO70570 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PigrO70570 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PigrO70570 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PigrO70570 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PigrO70570 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PigrO70570 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PigrO70570 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PigrO70570 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PigrO70570 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PigrO70570 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PigrO70570 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PigrO70570 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PigrO70570 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PigrO70570 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PigrO70570 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PigrO70570 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PigrO70570 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PigrO70570 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PigrO70570 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PigrO70570 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PigrO70570 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PigrO70570 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PigrO70570 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PigrO70570 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PigrO70570 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PigrO70570 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PigrO70570 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PigrO70570 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PigrO70570 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PigrO70570 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PigrO70570 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PigrO70570 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PigrO70570 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PigrO70570 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PigrO70570 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PigrO70570 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PigrO70570 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PigrO70570 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PigrO70570 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PigrO70570 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PigrO70570 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PigrO70570 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PigrO70570 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PigrO70570 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PigrO70570 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PigrO70570 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PigrO70570 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PigrO70570 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PigrO70570 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PigrO70570 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PigrO70570 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PigrO70570 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PigrO70570 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PigrO70570 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PigrO70570 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PigrO70570 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PigrO70570 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PigrO70570 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PigrO70570 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PigrO70570 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PigrO70570 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PigrO70570 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PigrO70570 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PigrO70570 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PigrO70570 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PigrO70570 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PigrO70570 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PigrO70570 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PigrO70570 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PigrO70570 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PigrO70570 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PigrO70570 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PigrO70570 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PigrO70570 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PigrO70570 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PigrO70570 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PigrO70570 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PigrO70570 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PigrO70570 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PigrO70570 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PigrO70570 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PigrO70570 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PigrO70570 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PigrO70570 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PigrO70570 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PigrO70570 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PigrO70570 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PigrO70570 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PigrO70570 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PigrO70570 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PigrO70570 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PigrO70570 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PigrO70570 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PigrO70570 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PigrO70570 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms