Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Srpk1O70551 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Srpk1O70551 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srpk1O70551 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srpk1O70551 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srpk1O70551 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srpk1O70551 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srpk1O70551 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srpk1O70551 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srpk1O70551 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srpk1O70551 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srpk1O70551 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srpk1O70551 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srpk1O70551 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srpk1O70551 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srpk1O70551 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srpk1O70551 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srpk1O70551 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srpk1O70551 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srpk1O70551 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srpk1O70551 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srpk1O70551 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srpk1O70551 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srpk1O70551 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk1O70551 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk1O70551 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srpk1O70551 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srpk1O70551 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srpk1O70551 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srpk1O70551 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srpk1O70551 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srpk1O70551 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Srpk1O70551 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srpk1O70551 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Srpk1O70551 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srpk1O70551 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srpk1O70551 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Srpk1O70551 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srpk1O70551 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srpk1O70551 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srpk1O70551 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srpk1O70551 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srpk1O70551 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srpk1O70551 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srpk1O70551 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srpk1O70551 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srpk1O70551 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srpk1O70551 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srpk1O70551 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Srpk1O70551 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srpk1O70551 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srpk1O70551 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srpk1O70551 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srpk1O70551 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srpk1O70551 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Srpk1O70551 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srpk1O70551 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srpk1O70551 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srpk1O70551 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srpk1O70551 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srpk1O70551 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srpk1O70551 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms