Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ChkaO54804 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ChkaO54804 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChkaO54804 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChkaO54804 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChkaO54804 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChkaO54804 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChkaO54804 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChkaO54804 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChkaO54804 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChkaO54804 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChkaO54804 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChkaO54804 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChkaO54804 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ChkaO54804 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ChkaO54804 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChkaO54804 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChkaO54804 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChkaO54804 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChkaO54804 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChkaO54804 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ChkaO54804 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChkaO54804 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChkaO54804 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChkaO54804 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChkaO54804 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChkaO54804 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChkaO54804 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ChkaO54804 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChkaO54804 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChkaO54804 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChkaO54804 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChkaO54804 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChkaO54804 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChkaO54804 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChkaO54804 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChkaO54804 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChkaO54804 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChkaO54804 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChkaO54804 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChkaO54804 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChkaO54804 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChkaO54804 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChkaO54804 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChkaO54804 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChkaO54804 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChkaO54804 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChkaO54804 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChkaO54804 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ChkaO54804 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChkaO54804 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChkaO54804 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChkaO54804 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms