Protein–RNA interactions for Protein: O35664

Ifnar2, Interferon alpha/beta receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar2O35664 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ifnar2O35664 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifnar2O35664 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifnar2O35664 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifnar2O35664 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifnar2O35664 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifnar2O35664 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifnar2O35664 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifnar2O35664 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifnar2O35664 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifnar2O35664 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifnar2O35664 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ifnar2O35664 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ifnar2O35664 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifnar2O35664 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifnar2O35664 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifnar2O35664 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ifnar2O35664 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifnar2O35664 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnar2O35664 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnar2O35664 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnar2O35664 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnar2O35664 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifnar2O35664 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifnar2O35664 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnar2O35664 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnar2O35664 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnar2O35664 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnar2O35664 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifnar2O35664 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnar2O35664 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnar2O35664 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnar2O35664 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifnar2O35664 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms