Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cpsf2O35218 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cpsf2O35218 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cpsf2O35218 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cpsf2O35218 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpsf2O35218 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpsf2O35218 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpsf2O35218 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpsf2O35218 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpsf2O35218 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpsf2O35218 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpsf2O35218 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpsf2O35218 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpsf2O35218 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cpsf2O35218 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf2O35218 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf2O35218 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cpsf2O35218 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cpsf2O35218 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cpsf2O35218 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cpsf2O35218 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cpsf2O35218 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cpsf2O35218 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cpsf2O35218 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cpsf2O35218 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cpsf2O35218 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cpsf2O35218 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cpsf2O35218 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cpsf2O35218 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cpsf2O35218 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cpsf2O35218 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpsf2O35218 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cpsf2O35218 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cpsf2O35218 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpsf2O35218 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpsf2O35218 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cpsf2O35218 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cpsf2O35218 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpsf2O35218 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpsf2O35218 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpsf2O35218 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpsf2O35218 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpsf2O35218 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cpsf2O35218 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms