Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RrhO35214 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RrhO35214 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RrhO35214 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RrhO35214 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RrhO35214 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RrhO35214 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RrhO35214 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RrhO35214 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RrhO35214 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RrhO35214 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RrhO35214 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RrhO35214 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RrhO35214 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RrhO35214 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RrhO35214 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RrhO35214 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RrhO35214 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RrhO35214 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RrhO35214 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RrhO35214 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RrhO35214 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RrhO35214 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RrhO35214 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RrhO35214 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RrhO35214 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RrhO35214 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RrhO35214 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RrhO35214 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RrhO35214 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RrhO35214 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RrhO35214 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RrhO35214 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RrhO35214 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RrhO35214 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RrhO35214 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RrhO35214 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RrhO35214 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RrhO35214 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RrhO35214 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RrhO35214 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RrhO35214 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RrhO35214 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RrhO35214 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RrhO35214 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RrhO35214 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RrhO35214 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RrhO35214 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RrhO35214 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RrhO35214 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RrhO35214 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RrhO35214 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RrhO35214 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RrhO35214 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RrhO35214 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RrhO35214 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RrhO35214 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RrhO35214 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RrhO35214 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RrhO35214 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RrhO35214 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RrhO35214 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RrhO35214 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RrhO35214 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RrhO35214 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RrhO35214 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RrhO35214 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RrhO35214 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RrhO35214 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RrhO35214 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RrhO35214 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RrhO35214 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RrhO35214 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RrhO35214 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RrhO35214 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RrhO35214 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RrhO35214 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RrhO35214 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RrhO35214 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RrhO35214 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RrhO35214 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RrhO35214 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RrhO35214 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RrhO35214 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RrhO35214 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RrhO35214 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RrhO35214 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RrhO35214 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RrhO35214 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RrhO35214 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RrhO35214 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RrhO35214 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RrhO35214 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RrhO35214 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RrhO35214 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RrhO35214 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RrhO35214 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RrhO35214 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RrhO35214 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RrhO35214 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms