Protein–RNA interactions for Protein: L7N280

Gm21962, Predicted gene, 21962, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21962L7N280 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm21962L7N280 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm21962L7N280 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm21962L7N280 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm21962L7N280 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm21962L7N280 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm21962L7N280 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm21962L7N280 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm21962L7N280 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm21962L7N280 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm21962L7N280 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm21962L7N280 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm21962L7N280 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm21962L7N280 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm21962L7N280 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm21962L7N280 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm21962L7N280 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm21962L7N280 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm21962L7N280 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm21962L7N280 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm21962L7N280 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm21962L7N280 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm21962L7N280 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm21962L7N280 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm21962L7N280 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm21962L7N280 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm21962L7N280 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms