Protein–RNA interactions for Protein: J3S6Y1

Tspear, Thrombospondin-type laminin G domain and EAR repeat-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspearJ3S6Y1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TspearJ3S6Y1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TspearJ3S6Y1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TspearJ3S6Y1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TspearJ3S6Y1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TspearJ3S6Y1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TspearJ3S6Y1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TspearJ3S6Y1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TspearJ3S6Y1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TspearJ3S6Y1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TspearJ3S6Y1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TspearJ3S6Y1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TspearJ3S6Y1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TspearJ3S6Y1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TspearJ3S6Y1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TspearJ3S6Y1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TspearJ3S6Y1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TspearJ3S6Y1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TspearJ3S6Y1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TspearJ3S6Y1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TspearJ3S6Y1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TspearJ3S6Y1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TspearJ3S6Y1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TspearJ3S6Y1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TspearJ3S6Y1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TspearJ3S6Y1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TspearJ3S6Y1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TspearJ3S6Y1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TspearJ3S6Y1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TspearJ3S6Y1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TspearJ3S6Y1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TspearJ3S6Y1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TspearJ3S6Y1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TspearJ3S6Y1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TspearJ3S6Y1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TspearJ3S6Y1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TspearJ3S6Y1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TspearJ3S6Y1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TspearJ3S6Y1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TspearJ3S6Y1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TspearJ3S6Y1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TspearJ3S6Y1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TspearJ3S6Y1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TspearJ3S6Y1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TspearJ3S6Y1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TspearJ3S6Y1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TspearJ3S6Y1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TspearJ3S6Y1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TspearJ3S6Y1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TspearJ3S6Y1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TspearJ3S6Y1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TspearJ3S6Y1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TspearJ3S6Y1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TspearJ3S6Y1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms