Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700014D04RikJ3QMS2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700014D04RikJ3QMS2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700014D04RikJ3QMS2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700014D04RikJ3QMS2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700014D04RikJ3QMS2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
1700014D04RikJ3QMS2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700014D04RikJ3QMS2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700014D04RikJ3QMS2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700014D04RikJ3QMS2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700014D04RikJ3QMS2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700014D04RikJ3QMS2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700014D04RikJ3QMS2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700014D04RikJ3QMS2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700014D04RikJ3QMS2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700014D04RikJ3QMS2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700014D04RikJ3QMS2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms