Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cldn34c3J3QJW5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn34c3J3QJW5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34c3J3QJW5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn34c3J3QJW5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms