Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp2b1G5E829 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp2b1G5E829 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp2b1G5E829 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp2b1G5E829 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp2b1G5E829 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp2b1G5E829 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp2b1G5E829 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp2b1G5E829 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp2b1G5E829 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp2b1G5E829 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp2b1G5E829 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp2b1G5E829 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp2b1G5E829 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp2b1G5E829 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp2b1G5E829 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp2b1G5E829 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp2b1G5E829 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp2b1G5E829 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp2b1G5E829 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b1G5E829 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b1G5E829 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b1G5E829 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b1G5E829 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b1G5E829 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2b1G5E829 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2b1G5E829 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp2b1G5E829 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp2b1G5E829 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b1G5E829 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b1G5E829 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b1G5E829 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b1G5E829 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b1G5E829 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp2b1G5E829 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp2b1G5E829 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp2b1G5E829 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp2b1G5E829 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp2b1G5E829 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp2b1G5E829 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2b1G5E829 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2b1G5E829 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2b1G5E829 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atp2b1G5E829 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp2b1G5E829 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp2b1G5E829 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b1G5E829 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Atp2b1G5E829 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b1G5E829 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b1G5E829 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b1G5E829 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b1G5E829 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b1G5E829 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b1G5E829 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp2b1G5E829 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b1G5E829 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp2b1G5E829 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp2b1G5E829 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp2b1G5E829 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp2b1G5E829 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp2b1G5E829 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp2b1G5E829 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp2b1G5E829 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp2b1G5E829 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp2b1G5E829 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp2b1G5E829 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp2b1G5E829 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp2b1G5E829 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp2b1G5E829 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp2b1G5E829 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp2b1G5E829 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp2b1G5E829 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp2b1G5E829 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp2b1G5E829 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp2b1G5E829 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp2b1G5E829 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms