Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nkx1-1G3UXB3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nkx1-1G3UXB3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nkx1-1G3UXB3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nkx1-1G3UXB3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nkx1-1G3UXB3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nkx1-1G3UXB3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nkx1-1G3UXB3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nkx1-1G3UXB3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Nkx1-1G3UXB3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nkx1-1G3UXB3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nkx1-1G3UXB3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx1-1G3UXB3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx1-1G3UXB3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nkx1-1G3UXB3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Nkx1-1G3UXB3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nkx1-1G3UXB3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nkx1-1G3UXB3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nkx1-1G3UXB3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nkx1-1G3UXB3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Nkx1-1G3UXB3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Nkx1-1G3UXB3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nkx1-1G3UXB3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx1-1G3UXB3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx1-1G3UXB3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nkx1-1G3UXB3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nkx1-1G3UXB3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nkx1-1G3UXB3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx1-1G3UXB3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx1-1G3UXB3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx1-1G3UXB3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx1-1G3UXB3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx1-1G3UXB3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nkx1-1G3UXB3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx1-1G3UXB3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nkx1-1G3UXB3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nkx1-1G3UXB3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nkx1-1G3UXB3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nkx1-1G3UXB3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nkx1-1G3UXB3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nkx1-1G3UXB3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Nkx1-1G3UXB3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nkx1-1G3UXB3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nkx1-1G3UXB3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nkx1-1G3UXB3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nkx1-1G3UXB3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx1-1G3UXB3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx1-1G3UXB3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Nkx1-1G3UXB3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Nkx1-1G3UXB3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nkx1-1G3UXB3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nkx1-1G3UXB3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nkx1-1G3UXB3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nkx1-1G3UXB3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nkx1-1G3UXB3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nkx1-1G3UXB3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nkx1-1G3UXB3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nkx1-1G3UXB3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nkx1-1G3UXB3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nkx1-1G3UXB3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nkx1-1G3UXB3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nkx1-1G3UXB3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nkx1-1G3UXB3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nkx1-1G3UXB3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Nkx1-1G3UXB3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nkx1-1G3UXB3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nkx1-1G3UXB3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nkx1-1G3UXB3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nkx1-1G3UXB3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nkx1-1G3UXB3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nkx1-1G3UXB3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nkx1-1G3UXB3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nkx1-1G3UXB3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nkx1-1G3UXB3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx1-1G3UXB3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx1-1G3UXB3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nkx1-1G3UXB3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx1-1G3UXB3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx1-1G3UXB3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx1-1G3UXB3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nkx1-1G3UXB3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nkx1-1G3UXB3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nkx1-1G3UXB3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Nkx1-1G3UXB3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nkx1-1G3UXB3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nkx1-1G3UXB3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nkx1-1G3UXB3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms