Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdzd7E9Q9W7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdzd7E9Q9W7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd7E9Q9W7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd7E9Q9W7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd7E9Q9W7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd7E9Q9W7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd7E9Q9W7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd7E9Q9W7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd7E9Q9W7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd7E9Q9W7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd7E9Q9W7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd7E9Q9W7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd7E9Q9W7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd7E9Q9W7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzd7E9Q9W7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdzd7E9Q9W7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms