Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vmn2r35E9Q7U8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn2r35E9Q7U8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r35E9Q7U8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r35E9Q7U8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r35E9Q7U8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r35E9Q7U8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r35E9Q7U8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r35E9Q7U8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r35E9Q7U8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r35E9Q7U8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r35E9Q7U8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r35E9Q7U8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r35E9Q7U8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r35E9Q7U8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r35E9Q7U8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r35E9Q7U8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r35E9Q7U8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r35E9Q7U8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms