Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srsf11E9Q6E5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srsf11E9Q6E5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srsf11E9Q6E5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srsf11E9Q6E5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms