Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
4930407I10RikD3Z5T8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
4930407I10RikD3Z5T8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
4930407I10RikD3Z5T8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
4930407I10RikD3Z5T8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
4930407I10RikD3Z5T8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
4930407I10RikD3Z5T8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
4930407I10RikD3Z5T8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
4930407I10RikD3Z5T8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
4930407I10RikD3Z5T8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
4930407I10RikD3Z5T8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
4930407I10RikD3Z5T8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
4930407I10RikD3Z5T8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
4930407I10RikD3Z5T8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
4930407I10RikD3Z5T8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
4930407I10RikD3Z5T8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
4930407I10RikD3Z5T8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
4930407I10RikD3Z5T8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
4930407I10RikD3Z5T8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
4930407I10RikD3Z5T8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
4930407I10RikD3Z5T8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
4930407I10RikD3Z5T8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
4930407I10RikD3Z5T8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
4930407I10RikD3Z5T8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
4930407I10RikD3Z5T8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
4930407I10RikD3Z5T8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
4930407I10RikD3Z5T8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
4930407I10RikD3Z5T8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
4930407I10RikD3Z5T8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
4930407I10RikD3Z5T8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
4930407I10RikD3Z5T8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
4930407I10RikD3Z5T8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
4930407I10RikD3Z5T8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
4930407I10RikD3Z5T8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
4930407I10RikD3Z5T8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
4930407I10RikD3Z5T8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
4930407I10RikD3Z5T8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
4930407I10RikD3Z5T8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
4930407I10RikD3Z5T8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
4930407I10RikD3Z5T8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
4930407I10RikD3Z5T8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
4930407I10RikD3Z5T8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
4930407I10RikD3Z5T8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
4930407I10RikD3Z5T8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
4930407I10RikD3Z5T8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
4930407I10RikD3Z5T8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
4930407I10RikD3Z5T8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
4930407I10RikD3Z5T8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
4930407I10RikD3Z5T8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
4930407I10RikD3Z5T8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
4930407I10RikD3Z5T8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
4930407I10RikD3Z5T8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
4930407I10RikD3Z5T8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
4930407I10RikD3Z5T8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
4930407I10RikD3Z5T8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
4930407I10RikD3Z5T8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
4930407I10RikD3Z5T8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
4930407I10RikD3Z5T8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
4930407I10RikD3Z5T8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
4930407I10RikD3Z5T8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
4930407I10RikD3Z5T8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
4930407I10RikD3Z5T8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
4930407I10RikD3Z5T8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
4930407I10RikD3Z5T8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
4930407I10RikD3Z5T8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
4930407I10RikD3Z5T8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
4930407I10RikD3Z5T8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
4930407I10RikD3Z5T8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
4930407I10RikD3Z5T8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
4930407I10RikD3Z5T8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
4930407I10RikD3Z5T8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
4930407I10RikD3Z5T8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
4930407I10RikD3Z5T8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
4930407I10RikD3Z5T8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
4930407I10RikD3Z5T8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
4930407I10RikD3Z5T8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
4930407I10RikD3Z5T8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
4930407I10RikD3Z5T8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
4930407I10RikD3Z5T8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
4930407I10RikD3Z5T8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
4930407I10RikD3Z5T8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
4930407I10RikD3Z5T8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms