Protein–RNA interactions for Protein: C0HKE7

Hist1h2an, Histone H2A type 1-N, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h2anC0HKE7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Hist1h2anC0HKE7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Hist1h2anC0HKE7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,05■■□□□ 1,12
Hist1h2anC0HKE7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22,04■■□□□ 1,12
Hist1h2anC0HKE7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Hist1h2anC0HKE7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Hist1h2anC0HKE7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Hist1h2anC0HKE7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Hist1h2anC0HKE7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Hist1h2anC0HKE7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Hist1h2anC0HKE7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Hist1h2anC0HKE7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Hist1h2anC0HKE7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22,01■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21,99■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21,95■■□□□ 1,11
Hist1h2anC0HKE7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21,91■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21,91■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Hist1h2anC0HKE7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Hist1h2anC0HKE7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Hist1h2anC0HKE7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Hist1h2anC0HKE7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
Hist1h2anC0HKE7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
Hist1h2anC0HKE7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Hist1h2anC0HKE7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Hist1h2anC0HKE7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Hist1h2anC0HKE7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Hist1h2anC0HKE7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Hist1h2anC0HKE7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21,85■■□□□ 1,09
Hist1h2anC0HKE7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Hist1h2anC0HKE7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Hist1h2anC0HKE7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Hist1h2anC0HKE7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21,77■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Hist1h2anC0HKE7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,07
Hist1h2anC0HKE7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Hist1h2anC0HKE7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Hist1h2anC0HKE7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21,76■■□□□ 1,07
Hist1h2anC0HKE7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Hist1h2anC0HKE7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Hist1h2anC0HKE7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Hist1h2anC0HKE7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Hist1h2anC0HKE7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Hist1h2anC0HKE7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Hist1h2anC0HKE7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Hist1h2anC0HKE7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,2 ms