Protein–RNA interactions for Protein: B2RUK9

Zfp456, Zinc finger protein 456, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp456B2RUK9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp456B2RUK9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp456B2RUK9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp456B2RUK9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp456B2RUK9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp456B2RUK9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp456B2RUK9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp456B2RUK9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp456B2RUK9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp456B2RUK9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp456B2RUK9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp456B2RUK9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp456B2RUK9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp456B2RUK9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp456B2RUK9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp456B2RUK9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp456B2RUK9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp456B2RUK9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp456B2RUK9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp456B2RUK9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp456B2RUK9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp456B2RUK9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zfp456B2RUK9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp456B2RUK9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp456B2RUK9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp456B2RUK9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp456B2RUK9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp456B2RUK9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp456B2RUK9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp456B2RUK9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp456B2RUK9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp456B2RUK9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp456B2RUK9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp456B2RUK9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp456B2RUK9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp456B2RUK9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms