Protein–RNA interactions for Protein: B2RT44

Lonrf2, LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf2B2RT44 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lonrf2B2RT44 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lonrf2B2RT44 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lonrf2B2RT44 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf2B2RT44 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf2B2RT44 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lonrf2B2RT44 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lonrf2B2RT44 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lonrf2B2RT44 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lonrf2B2RT44 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lonrf2B2RT44 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lonrf2B2RT44 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lonrf2B2RT44 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lonrf2B2RT44 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lonrf2B2RT44 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lonrf2B2RT44 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lonrf2B2RT44 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lonrf2B2RT44 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lonrf2B2RT44 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lonrf2B2RT44 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lonrf2B2RT44 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lonrf2B2RT44 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lonrf2B2RT44 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lonrf2B2RT44 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lonrf2B2RT44 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lonrf2B2RT44 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lonrf2B2RT44 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lonrf2B2RT44 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lonrf2B2RT44 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lonrf2B2RT44 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lonrf2B2RT44 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lonrf2B2RT44 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lonrf2B2RT44 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lonrf2B2RT44 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lonrf2B2RT44 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lonrf2B2RT44 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lonrf2B2RT44 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lonrf2B2RT44 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lonrf2B2RT44 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lonrf2B2RT44 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lonrf2B2RT44 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lonrf2B2RT44 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lonrf2B2RT44 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lonrf2B2RT44 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lonrf2B2RT44 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lonrf2B2RT44 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lonrf2B2RT44 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lonrf2B2RT44 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms