Protein–RNA interactions for Protein: A6H6Q4

Uncharacterized protein C19orf71 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6H6Q4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6H6Q4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6H6Q4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6H6Q4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6H6Q4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6H6Q4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6H6Q4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6H6Q4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
A6H6Q4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6H6Q4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6H6Q4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6H6Q4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6H6Q4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6H6Q4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6H6Q4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6H6Q4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6H6Q4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6H6Q4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A6H6Q4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A6H6Q4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A6H6Q4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A6H6Q4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
A6H6Q4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A6H6Q4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A6H6Q4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A6H6Q4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A6H6Q4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
A6H6Q4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A6H6Q4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A6H6Q4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A6H6Q4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A6H6Q4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A6H6Q4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A6H6Q4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A6H6Q4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6H6Q4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6H6Q4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6H6Q4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6H6Q4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6H6Q4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6H6Q4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6H6Q4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms