Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htra4A2RT60 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Htra4A2RT60 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htra4A2RT60 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htra4A2RT60 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Htra4A2RT60 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htra4A2RT60 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htra4A2RT60 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htra4A2RT60 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htra4A2RT60 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htra4A2RT60 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htra4A2RT60 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htra4A2RT60 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htra4A2RT60 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htra4A2RT60 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htra4A2RT60 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htra4A2RT60 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htra4A2RT60 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htra4A2RT60 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Htra4A2RT60 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Htra4A2RT60 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Htra4A2RT60 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Htra4A2RT60 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Htra4A2RT60 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Htra4A2RT60 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Htra4A2RT60 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Htra4A2RT60 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Htra4A2RT60 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Htra4A2RT60 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Htra4A2RT60 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Htra4A2RT60 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Htra4A2RT60 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Htra4A2RT60 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Htra4A2RT60 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms