Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Patl2A2ARM1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Patl2A2ARM1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Patl2A2ARM1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Patl2A2ARM1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Patl2A2ARM1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Patl2A2ARM1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Patl2A2ARM1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Patl2A2ARM1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Patl2A2ARM1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Patl2A2ARM1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Patl2A2ARM1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Patl2A2ARM1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Patl2A2ARM1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Patl2A2ARM1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Patl2A2ARM1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Patl2A2ARM1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Patl2A2ARM1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Patl2A2ARM1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Patl2A2ARM1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Patl2A2ARM1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Patl2A2ARM1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Patl2A2ARM1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Patl2A2ARM1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Patl2A2ARM1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Patl2A2ARM1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Patl2A2ARM1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Patl2A2ARM1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Patl2A2ARM1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Patl2A2ARM1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms