Protein–RNA interactions for Protein: A2AJW4

Ppp1r3d, Protein phosphatase 1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3dA2AJW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3dA2AJW4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3dA2AJW4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3dA2AJW4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3dA2AJW4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3dA2AJW4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3dA2AJW4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3dA2AJW4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3dA2AJW4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3dA2AJW4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3dA2AJW4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3dA2AJW4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3dA2AJW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r3dA2AJW4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ppp1r3dA2AJW4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppp1r3dA2AJW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r3dA2AJW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppp1r3dA2AJW4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppp1r3dA2AJW4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp1r3dA2AJW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp1r3dA2AJW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp1r3dA2AJW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms