Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp47Q8BY87 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp47Q8BY87 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Usp47Q8BY87 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Usp47Q8BY87 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Usp47Q8BY87 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp47Q8BY87 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp47Q8BY87 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp47Q8BY87 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp47Q8BY87 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp47Q8BY87 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp47Q8BY87 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp47Q8BY87 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Usp47Q8BY87 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Usp47Q8BY87 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp47Q8BY87 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp47Q8BY87 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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