Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp54Q8BL06 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp54Q8BL06 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms