Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Actn1Q7TPR4 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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