Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms