Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pkp1P97350 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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