Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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