Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ptpn9O35239 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms