Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms