Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms