Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

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Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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