Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
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Rpusd2Q149F1 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
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Rpusd2Q149F1 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rpusd2Q149F1 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rpusd2Q149F1 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rpusd2Q149F1 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rpusd2Q149F1 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rpusd2Q149F1 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms