Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ggta1P23336 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ggta1P23336 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Ggta1P23336 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Ggta1P23336 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ggta1P23336 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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