Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
P10404 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
P10404 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
P10404 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
P10404 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
P10404 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
P10404 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
P10404 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
P10404 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms