Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ankrd34aB2RW11 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ankrd34aB2RW11 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ankrd34aB2RW11 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ankrd34aB2RW11 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ankrd34aB2RW11 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms