Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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