Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 St6gal1-206ENSMUST00000178797 4177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Tlr5-201ENSMUST00000110997 3199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28229-201ENSMUST00000188747 2153 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Serpina3f-202ENSMUST00000121337 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33111-202ENSMUST00000219954 3388 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Sncaip-202ENSMUST00000115410 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Oca2-201ENSMUST00000032633 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gata4-203ENSMUST00000121312 2407 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp82-203ENSMUST00000182546 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp260-201ENSMUST00000050735 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Hdhd2-208ENSMUST00000148955 3069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm12949-201ENSMUST00000143382 362 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Gtpbp6Q3U6U5 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Gtpbp6Q3U6U5 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Sox6-203ENSMUST00000166207 2825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Gtpbp6Q3U6U5 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Gtpbp6Q3U6U5 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Gtpbp6Q3U6U5 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
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Gtpbp6Q3U6U5 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Champ1-202ENSMUST00000128557 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37821-201ENSMUST00000195476 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Snapc4-202ENSMUST00000114115 4368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Mei1-203ENSMUST00000188048 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
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