Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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