Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VgfQ0VGU4 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms