Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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