Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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VdrP48281 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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VdrP48281 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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VdrP48281 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VdrP48281 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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VdrP48281 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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